スイストラベルパスの利用(追加)

今年、9月、スイス旅行を計画しています。スイス国内ではトラベルパスを利用する予定です。
昨日も以下のプランに関してお尋ねしましたが、追加で教えてほしいことがあります。

4日目：サンモリッツ→チューリヒ→(バーゼル経由)→フランクフルト中央駅

１．4日目のバーゼル～フランクフルト駅までの乗車券は大体いくらでしょうか？(チューリヒ～バーゼルはトラベルパス有効)何€？何㌵でしょうか？検索できるサイトもご存知でしたら教えてください。また、日本で買うのではなくて現地の窓口で購入する方がいいと思いますか？

私はレイルヨーロッパで調べていますが若干高いような気がします。為替レートにもよりますが現地で買った方が安いんでしょうかね

２．１と関係しますが…

レイルヨーロッパでバーゼル～フランクフルトを検索しますとフレキシー料金が表示されるのですが、格安料金は表示されません。しかし、シャフハウゼン～フランクフルト(バーゼル経由)を検索しますと格安料金、フレキシー料金が表示されます。なぜかシャフハウゼンから買ったほうが安いんです。なぜって思ったのですが、これは格安料金を選べるから？だと思います。

私は、単にバーゼル～フランクフルトの切符がほしいだけなんですが、もし、日本で切符を準備する場合、シャフハウゼンから格安料金で買った方がいいということになりますね？(本当にこれで大丈夫なのか自信がなくて)？チューリヒ駅でバーゼル～フランクフルトの乗車券、買った方が安くなりますか？

レイルヨーロッパ(http://www.raileurope-japan.com/)

日時：9/21
バーゼル～フランクフルト　PM4：00　フレキシー料金：12600～13300円
シャフハウゼン～フランクフルト(バーゼル経由)　PM2：00　格安料金：10900～13600円　フレキシー料金：14000～14700円

３．レイルヨーロッパで旅行前に切符を準備できるのはいいのですが、手配される切符は座席が指定されてしまいますよね？もし電車に乗り遅れたら、切符は無効になってしまうんでしょうか？(次の便に乗れる？)乗車時間が自由に選択できる区間乗車券は現地の窓口で購入するしかないんでしょうか？