私がこのサイトに登録しましたのが今日の10/19/2015で、何故か過去の質問に関しての回答率が０となっておりましたので、遅いと思いますが連絡します。
春から夏にかけてのアルカトラズのチケットは結構人気で、せめて１ヶ月前までには予約をした方が良いと思います。この前、私の友達が１週間前に予約をしようと、サイトに行ったら全然予定が空いておらず、１ヶ月先の予定しか取れない状態でした。秋から冬は寒いので２週間前でも予約は取れると思います。
予約はこちらのサイトで出来ます：
https://www.alcatrazcruises.com/website/tour-comparison.aspx

ヨシミさん、
今日10/19/2015始めてトラベロコに登録したら、過去の質問への回答が0という数値がいきなり出てきたので、遅いとは思いますが今回答メールを書いているところです。
確かにグレイシャーポイントへは、ヨセミテ公園からのツアーはありますが、サンフランシスコから往復してグレーシャーポイントへ行く一般的なツアーは無いようですね。なので、もし全てを含めたツアーをお探しなのであれば、「プライベートツアー」で見積もりを貰うことが良いのではと思います。以下はプライベートツアーの参照サイトです。
http://yosemitecustomtours.com/
http://www.extranomical.com/HTML_PAGES/YOSEMITE_PRIVATE_TOUR.htm

Yosemite LodgeからEl Capitan, Bridalveil Fall, Half Dome and Yosemite Falls in Yosemite Valley, Tunnel View, and Glacier Pointを連れて行ってくれるツアーは以下があります。
http://www.yosemitepark.com/glacier-point-tour.aspx

ヨセミテ訪問は、春・夏にかけて世界各国から観光客がきますので、やはり前もって申し込んでおいた方が良いでしょう。以下は参照サイトです。
http://www.extranomical.com/HTML_PAGES/YOSEMITE_HOTELROOM_OPTIONS_TWO_DAY.htm
私もこのextranomicalは使用したことがあります。少人数のバンでの往復で自分で運転しないで良いし、陽気な運転手がガイドしながら英語で案内してくましたので楽しかったです。

日本語案内の場合は、この前この会社のツアーを仕事上頼まれて予約しました。
http://www.veltra.com/jp/north_america/san_francisco/a/7127

かすみさん、
問い合わせありがとうございます。
１、サンフランシスコからディズニーランドまでの交通手段ですが、バス/電車・飛行機・レンタカー・ツアーの４種類の方法かと思います。
a)飛行機：今ざっと見ましたら、安くて片道＄１２５のチケットがあります
b)バス/電車：アムトラックとバスの混合でSF, CAからAnaheim, CA (ANA)まで出ていますが、約１１時間程度かかるようです。
c)ツアー：サンフランシスコからツアーでディズニーランド・ユニバーサルスタジオ・ロサンジェルス４日間で約＄５００～７００であります。
２、何が目的によって変わってくると思います。例えば自然が好きだ、街で遊ぶほうが好きだ、ステージ・オペラ・ショー鑑賞で違ってくるかと思います。
３、Airbnbの他、ホストファミリー・ユースホテル等別な宿泊方法はあります。